关于公路水运造价工程师是否废除的问题，目前的信息表明：
交通部不再组织考试，正与人事部、住建部协商转为国家资格：
2018年起，交通部不再组织公路造价师考试，并正在与人事部和住建部协商将其转为国家资格。
国务院已取消水运造价师资格：
有信息称国务院已经取消了水运造价师的资格。
资格证书效用不变：
根据《造价工程师职业资格制度规定》（建人〔2018〕67号），公路工程造价人员资格证书效用不变，交通运输部将出台配套贯彻实施文件，明确新老证书的有效衔接。
综合以上信息，可以得出以下结论：
公路造价师：虽然交通部不再组织相关考试，但资格证书仍然有效，并正在与人事部、住建部协商转为国家资格。因此，公路造价师资格并未完全废除。
水运造价师：国务院已经取消了水运造价师的资格，相关的执业资格需要转为国家资格。
建议：
对于已经取得公路造价师资格证书的人员，应关注交通运输部后续出台的具体衔接政策，以确保其资格的有效性。
对于计划考取公路造价师的人员，可以考虑转向其他相关的国家职业资格考试，如注册造价工程师等。