信息安全工程师的理论基础主要包括以下几个方面：
特有理论基础
访问控制理论：涉及各种访问控制模型和授权理论，确保只有授权用户才能访问特定资源。
博弈论：研究个人、团队或组织在特定环境和规则约束下，如何选择行为或策略以达到最佳结果或收益。
密码学：包括密码编制和密码分析学，研究加密和解密技术，确保数据的安全性。
网络安全系统的设计原则
木桶原则：系统的安全性取决于最脆弱的环节。
整体性原则：系统各部分必须协同工作，共同维护安全性。
有效性和实用性原则：安全措施应能实际生效并满足需求。
安全性评价原则：通过系统化的方法评估系统的安全性。
等级性原则：根据安全需求划分不同的安全等级。
设计为本原则：安全设计应贯穿整个系统开发过程。
自主和可控性原则：系统应能自主控制其安全措施。
权限最小化原则：只授予必要的最小权限。
有的放矢原则：针对具体威胁采取相应措施。
网络管理体系结构
包括协议、表示、安全、对象、开放系统互连安全体系结构示意图、安全服务、鉴别服务、访问控制、数据完整性、数据保密性、不可抵赖性、安全机制、加密、数字签名等组成部分。
信息安全方法论
包括理论分析、逆向分析、实验验证、技术实现等方法，用于研究和解决安全问题。
信息系统安全层次
可以划分为设备稳定性、设备安全、设备可用性、数据秘密性、数据安全、数据完整性、数据可用性、政治健康、内容安全、行为秘密性、行为安全、行为完整性、行为的可控性等层次。
信息安全管理
涉及信息安全管理的原则和实践，包括安全策略的制定和执行、安全审计、风险评估、应急响应等。
这些理论框架和方法论为信息安全工程师提供了系统化的思维和方法，帮助他们在实际工作中识别、评估和应对各种安全威胁。建议在实际工作中不断学习和实践这些理论，以提高信息安全保障能力。