甲方安全工程师在管理工程项目时，可以采取以下措施：
熟悉安全标准和法规
了解国家安全生产法、建筑安全法等，确保项目安全管理符合法律要求。
建立安全管理制度
制定安全生产责任制、安全教育培训制度、安全检查制度等，确保项目安全管理有效实施。
指导工程安全设计
对工程设计进行安全评估和指导，确保设计符合安全标准和法规要求，并与设计单位沟通协调，保障设计方案的安全性。
监督工程施工安全
对施工现场进行安全监督，包括安全防护设施的设置和施工现场的安全管理，及时发现并处理安全隐患，确保施工过程中的安全性。
做好安全事故应急处理
制定应急预案，组织应急演练，及时处理安全事故，避免事故扩大化，影响工程项目的正常进行。
持续学习和提升
不断学习和提升自身的安全管理能力，关注最新的安全标准和法规，积极参加相关培训和学习活动，提高专业水平。
审查施工单位和人员资格
确认施工单位施工资质和人员资格是否符合规定，检查是否存在超资质施工现象。
施工方案和安全措施
审查施工方案和安全技术措施是否可行，对容易发生问题的工序进行重点监管，如临时用电、起重作业、拆除作业、高处作业等。
风险评估与监督检查
根据工程进度进行风险识别，编制施工安全检查表，对现场进行安全监督检查，并做好隐患整改工作。
安全防护措施
确保安全防护措施如消防器材、安全帽、安全带、安全网、警示牌等到位。
现场环境与设施
检查场地情况、营地情况、员工饮食卫生、给排水临时设施等，做好夏季防高温、中暑、食物中毒等工作。
安全管理体系建设
制定安全管理制度和计划，明确各方安全责任，组织安全检查和评估，处理安全事故和隐患，开展安全教育和培训。
安全团队建设与培训
组建专业的安全管理团队，具备丰富的安全管理经验和技能，对安全管理团队进行全面培训和考核，提高其安全管理能力和水平。
监控与应急响应
建立事中的监控能力，包括多维度的入侵检测，做好事后的应急响应能力，提高应急的时间成本。
安全战略与治理
制定安全战略，明确安全的投入、方向和目标，建立独立的安全审计组织和安全治理组织及机制。
安全管理体系优化
根据组织现状，执行和优化安全管理体系，界定和层层落实安全责任。
资产盘点与漏洞管理
对资产进行盘点，发现并管理安全漏洞。
通过以上措施，甲方安全工程师可以全面有效地管理工程项目，确保项目的顺利进行和人员的安全。