如果您的一级建造师证书被骗注册到公司，您可以采取以下措施来解决问题：
向劳动监察部门投诉
首先，您可以向劳动监察部门投诉中介公司的欺骗行为。劳动监察部门会对此类行为进行调查，并可能帮助您追回证书。
收集证据
收集与中介的沟通记录、支付凭证等相关证据，这些证据在后续的法律维权过程中将起到关键作用。
寻求法律援助
如果劳动监察部门无法解决问题，您可以寻求法律援助，通过法律途径维权。您可以咨询律师，了解具体的法律程序和可能的赔偿方式。
联系公司协商
您还可以尝试联系注册证书的公司，与其协商解决证书取回的问题。有些公司可能会在了解到实际情况后，协助您取回证书。
通过调解或仲裁解决
如果协商无果，您可以通过调解或仲裁等方式寻求法律支持。这些途径通常比诉讼更为快捷和经济。
注销或变更注册
如果您已经支付了社会保险费用，且证书注册存在重复缴费情况，您可以携带相关证件前往注册挂靠单位所在地的社会保险管理机构，申请办理重复缴纳部分的社保注销业务。
警惕再次被骗
在整个过程中，保持警惕，避免再次被骗。一些不法分子可能会利用虚假信息继续行骗，因此请务必核实信息的真实性。
通过以上措施，您有望解决一级建造师证书被骗的问题，并尽量减少您的损失。