二级建造师注册遗失补办流程如下：
登报挂失
在省级及以上报刊发布二级建造师师证书遗失声明。
确认遗失声明后，需要购买当日的报纸作为补办材料。
网上申报
申请人通过个人二级建造师系统进行网上二级建造师注册证书遗失申报。
在公司二级建造师注册管理系统中同意申报，并提取“遗失补办申请表”并打印。
提交材料
携带以下资料至县一级主管部门进行资料审核：
《二级注册建造师注册证书､执业印章遗失补办或污损更换申请表》。
身份证明原件及复印件。
省级以上报纸刊登的遗失声明原件及复印件。
可能还需要提供其他相关证明文件，如资格考试合格人员登记表原件及复印件、考生身份证原件及复印件等。
审核与办理
提交材料后，由受理部门进行初审，主要审核材料的真实性和完整性。
初审通过后，材料将移交至市住房城乡建设委行政综合服务大厅进行复审，复审通过后进入制证制章阶段。
原注册机关应当在5日内办理完毕补办手续。
费用支付
补办过程中可能需要支付一定的工本费，具体费用标准因地区而异，一般在200元左右。
领取证书
补办完成后，申请人可以携带相关证明文件到指定地点领取新的二级建造师注册证书。
建议申请人在办理遗失补办手续时，提前咨询当地建设行政主管部门或相关机构，了解详细的办理流程和所需材料，以确保补办过程顺利进行。