水利监理工程师的加注流程如下：
确认证书资格
确认想要申请加注的证书资格是否符合国家标准和规定，包括专业和年限等要求。可以直接在监理工程师职业资格证书上查看或咨询相关机构。
收集申请材料
准备加注证书申请所需的材料，包括加注证书申请表、教育和培训经历证明、工作经验证明、专业技术资料和个人照片等。
提交申请材料
将申请材料提交给监理工程师资格证书颁发的认证机构。申请过程可能需要费用和一定的时间，需要提前做好准备。
等待加注证书
审核和处理申请材料需要时间，在确认申请材料齐全和符合要求之后，认证机构会将加注证书寄送给申请人。
建议提前准备好所有必要的材料，并在确认无误后及时提交申请，以确保加注过程顺利进行。