更换总监理工程师的程序通常包括以下几个步骤：
提交申请
原总监理工程师向主管部门提交书面申请，说明变更原因和变更后的人选，并提供相关材料。
监理单位向建设单位提出书面申请，经同意后，办理交接手续，报监理机构备案。
审核材料
主管部门审核申请材料是否符合要求，如有不足之处，提出补充要求。
监理单位需要提供书面报告、备案表和相关的证明材料，例如要求变更的原因及相关有效证明材料、企业任命总监理工程师的任职文件、建设单位与监理单位签订的变更补充合同、新任命总监理工程师的注册岗位证书等。
评审与批准
组织专家对申请材料进行评审，确认新总监理工程师的资格。
主管部门审核通过后，发出总监理工程师变更批准书。
确认与交接
新总监理工程师确认接受变更，并按规定履行注册手续。
办理交接手续，确保项目工作的连续性和合规性。
公告与备案
发布更换公告，通知相关各方。
变更完成后，需要报监理机构备案。
建议：
在进行总监理工程师更换时，应提前准备好所有必要的文件和材料，确保申请过程顺畅。
与建设单位和主管部门保持良好沟通，确保变更过程符合相关法规和合同要求。