一级建造师的注册证书在以下情况下会被终身吊销，并且不予注册：
违反行政法规或严重失职：
例如，因施工隧道透水事故导致14人死亡，项目经理被追责并受到吊销一级建造师注册证书，终身不予注册的行政处罚。
资格证书不会吊销：
尽管注册证书及章会被吊销，但一级建造师的资格证书本身不会吊销，在吊销期间不予重新注册。过了限制年限后，可以使用原资格证书重新申请注册，而无需重新考取资格证书，但需要每三年参加继续教育并提供相关证明。
总结：
终身吊销一级建造师注册证书并终身不予注册是对严重违法行为的严厉处罚措施。
资格证书本身不会因注册证书吊销而失效，但需要在规定年限后重新申请注册并提供继续教育证明。