中国药科大学：
国内最早设立制药工程专业的高校之一，教学和科研经验丰富，领军高校之一。
华东理工大学：
制药工程专业在国内享有较高声誉，拥有一流的实验设备和教学资源。
北京化工大学：
在药物合成和工艺优化方面研究实力强。
南京工业大学：
在药物制剂和药物分析方面研究实力强。
天津大学：
在制药工程作为工科方面表现突出。
清华大学：
排名靠前的学校之一。
大连理工大学：
在制药工程方面有一定影响力。
浙江大学：
在制药方面综合表现突出。
四川大学：
在制药方面综合表现突出。
山东大学：
在制药方面综合表现突出。
北京理工大学：
可报考的研究生院校。
中国科学院大学：
可报考的研究生院校。
南开大学：
可报考的研究生院校。
山西大学：
可报考的研究生院校。
中北大学：
可报考的研究生院校。
辽宁大学：
可报考的研究生院校。
东北农业大学：
可报考的研究生院校。
苏州大学：
可报考的研究生院校。
南京理工大学：
可报考的研究生院校。
江南大学：
可报考的研究生院校。
江苏大学：
位于江苏省镇江市，是江苏省人民政府与教育部、农业农村部共建的重点综合性大学，入选多项国家重点发展项目。
沈阳药科大学：
药学专业整体实力强，国家级重点学科。
北京大学：
药学专业考研的不错选择，学科实力在北京市处于领先地位。
复旦大学：
名气大，学科实力强。
建议在选择考研院校时，要综合考虑自己的兴趣、研究方向、学校实力和地理位置等因素，选择最适合自己的学校。