在职医师考研时，可以根据自己的职业规划和兴趣选择以下专业：
临床医学硕士
研究内容：涵盖疾病的病因、诊断、治疗和预后，旨在提高临床治疗水平，促进人体健康。
适用对象：具备一定临床经验的医生，可以选择继续攻读临床医学专业，该专业涵盖广泛的医疗领域，如内科、外科、儿科等。
注意事项：全国只有5个院校有临床医学专硕的非全日制计划，分别是内蒙古民族大学、同济大学、扬州大学、长江大学和中南大学。如果所在地不在这些地区，则此途径可能不适用。
基础医学硕士
研究内容：研究人体的基本结构和功能，疾病的机制，以及药物的作用原理等。
适用对象：适合对基础医学感兴趣的医生，尤其是希望在未来从事医学研究或教学的医生。
护理学硕士
研究内容：涵盖护理实践、护理管理、护理教育等方面，旨在培养具有高级护理技能的人才。
适用对象：希望提升护理技能和知识的医生，或有意向转向护理岗位的医生。
药学硕士
研究内容：研究药物的发现、开发、制剂、质量控制、作用机制、代谢、药效学、药物经济学等。
适用对象：对药物研发和临床应用感兴趣的医生，或希望在未来从事药学研究或管理的医生。
公共卫生与预防医学硕士
研究内容：涵盖公共卫生策略、疾病预防、健康教育、健康政策等方面，旨在提高人群健康水平。
适用对象：希望从事公共卫生工作，或对疾病预防和健康政策有浓厚兴趣的医生。
口腔医学硕士
研究内容：研究口腔颌面部的疾病的预防、诊断和治疗，包括口腔外科、口腔内科、口腔修复等。
适用对象：对口腔医学感兴趣的医生，或希望在未来从事口腔临床工作的医生。
中医学硕士
研究内容：研究中医学的理论和实践，包括中药、针灸、推拿等。
适用对象：对中医学有浓厚兴趣，或希望在中医学领域深入研究和实践的医生。
生物医学工程硕士
研究内容：结合生物学、医学和工程技术，研究医疗设备、诊断试剂、生物材料等。
适用对象：对生物医学工程感兴趣，或希望在未来从事医疗器械研发和管理的医生。
建议
结合职业目标：选择与自己职业发展最为相关的专业，以便在提升学历的同时，也能满足工作需求。
考虑学校和专业声誉：选择知名度高、专业实力强的学校，以确保学到的知识和技能能够得到广泛认可。
了解招生要求：不同学校和专业的招生要求不同，提前了解并确认自己是否符合报考条件。
注重学习方式：选择适合自己学习方式的硕士项目，如同等学力申硕，可以节省时间和精力。
通过以上分析，相信在职医师可以根据自己的实际情况和兴趣，选择最适合自己的考研专业。