福建省内可以报考硕士研究生的学校和研究院包括：
厦门大学
属于一流大学建设高校，坐落于福建省厦门市思明区思明南路422号，隶属于教育部管理。
福州大学
双一流大学之一。
自然资源部第三海洋研究所
直属自然资源部的国家公益一类综合型海洋科学研究机构，主要从事海洋基础研究、应用研究和高新技术研究。该所也是国务院学位委员会批准的硕士学位授予单位，并与国内多所著名高校联合培养硕士、博士研究生。
厦门国家会计学院
我国高层次财经财会人才的重要培养基地，直属于国家财政部。
建议您在选择报考福建的研究院时，可以综合考虑各研究机构的学科优势、研究方向、师资力量以及与自身兴趣和职业规划的相关性，以确保选择到最适合自己的学术环境和研究方向。