生物工程考研选择学校时，可以考虑以下一些知名院校：
北京大学：
生物工程专业享有高声誉，拥有优秀的师资力量和先进的教学设施。
清华大学：
生物科学与技术系是国内早期进行生物工程教育的单位之一，研究生培养具有深厚的学科基础。
上海交通大学：
生物工程专业在国内排名靠前，拥有强大的师资队伍和优良的实验条件。
浙江大学：
生物工程学院是对外开放的研究机构，提供先进的教学和科研设施。
华中农业大学：
在生物工程领域研究成果显著，拥有多个重点实验室。
华南理工大学：
生物医学工程专业实力强，招生人数相对较少，竞争压力小。
武汉大学：
生物学方面有优势，拥有一批知名的科研团队和教授。
复旦大学、 南京大学、 中国科学技术大学等也是生物工程专业考研的不错选择。
选择学校时，建议根据自己的兴趣、研究方向、以及学校的师资力量、科研条件、就业前景等多方面因素综合考虑。同时，可以参考最新的考研排名和专业的学科评估结果来做出决策。