是的，交通工程专业毕业生可以选择考研，进一步深造。考研时，交通工程专业的学生可以选择以下专业方向：
1. 交通运输规划与管理
2. 道路与铁道工程
3. 交通运输工程
4. 载运工具运用工程
5. 交通信息工程与控制
6. 交通规划方向
7. 交通土建
8. 工商管理
9. 道路交通安全
10. 交通控制方向
11. ITS方向
12. 车辆工程
13. 交通管理方向
14. 城市交通系统可持续发展理论与方法
15. 运输管理
16. 智能交通系统及控制工程
17. 城市交通控制及智能交通系统
考研科目通常包括政治、数学一、英语，而专业课程会根据选择的专业方向有所不同。例如，道路与铁道工程专业的专业课可能包括材料力学，而交通规划、交通信息工程等专业则侧重于交通工程学。
选择考研专业时，学生应根据自己的兴趣和职业规划来决定，同时可以参考各高校的研究生招生信息，选择适合的专业和导师。