中山大学研究生院的院系包括以下几类：
人文学科类
人文科学学院
中国语言文学系
历史学系
哲学系
亚太研究院
岭南学院
国际商务系
经济管理系
经济学系
金融系
财政税务系
风险管理与保险学系
物流工程与管理系
国际汉语学院
旅游学院
翻译学院
商务外语系
对外汉语系
西班牙语系
阿拉伯语系
朝鲜语系
社会科学类
政治与公共事务管理学院
政治科学系
行政管理学系
社会学与人类学学院
人类学系
社会学与社会工作系
管理学院
工商管理系
会计学系
旅游酒店管理系
市场学系
财务与投资系
管理科学系
教育学院
教育科学研究所
社会科学教育系（两课）
心理学系
体育教育系
传播与设计学院
创意媒体设计系
新闻学系
公共传播学系
知识产权学院
数学与计算科学学院
数学系
统计科学系
科学计算与计算机应用系
物理科学与工程技术学院
物理学系
微电子学系
光学与光学工程系
工学院
化学与化学工程学院
化学系
应用化学系
高分子与材料科学系
地理科学与规划学院
城市与区域规划系
遥感与地理信息工程系
国土资源与环境系（河口海岸研究所）
水资源与环境系
规划设计研究院
环境科学与工程学院
环境科学系
大气科学系
环境工程系
生命科学学院
生物科学与技术系
生物化学系
生态学系
海洋学院
信息科学与技术学院
电子通信工程系
计算机科学系
软件研究所
计算机应用研究所
自动化系
软件学院
资讯管理系
中山医学院
临床医学一系（长学制）
临床医学二系
麻醉学系
医学影像学系
康复治疗学系
医学检验系
眼科视光学系
法医学系
生物医学工程系
公共卫生学院
预防医学系
妇幼卫生系
营养学系
医学统计与流行病学系
卫生管理学系
光华口腔医学院
护理学院
药学院
高等继续教育学院（网络教育学院）
理工科类
机械科学与工程学院
计算机科学与技术学院
生命科学与技术学院
电气与电子工程学院
材料科学与工程学院
船舶与海洋工程学院
能源与动力工程学院
控制科学与工程系
水电与数字化工程学院
环境科学与工程学院
光学与电子信息学院
电子与信息工程系
建筑与城市规划学院
土木工程与力学学院
数学与统计学院
物理学院
化学与化工学院
经济学院
公共管理学院
新闻与信息传播学院
外国语学院
人文学院
哲学系
中文系
马克思主义学院
社会学系
法学院
基础医学院
药学院
医药卫生管理学院
公共卫生学院
法医学系
护理学系
计划生育研究所
第一临床学院
第二临床学院
第三临床学院
大学生艺术团
教育科学研究院
图像识别与人工智能研究所
历史研究所
国学研究院
体育部
网络与计算中心
现代教育技术中心
工程实训中心
国际教育学院
远程与继续教育学院
这些院系涵盖了文学、历史学、哲学、法学、经济学、管理学、教育学、理学、医学、工学、农学、艺术学等多个学科领域，具体专业设置和招生信息请参考中山大学最新公布的研究生招生专业目录。