化学结构专业考研学校有很多选择，以下是一些建议的学校：
北京大学
清华大学
中国科学技术大学
南开大学
南京大学
浙江大学
复旦大学
上海交通大学
武汉大学
中山大学
四川大学
哈尔滨工业大学
华南理工大学
郑州大学
中南大学
华东理工大学
福州大学
湖南科技大学
南昌航空大学
青岛大学
武汉工程大学
天津大学
大连理工大学
吉林大学
西安交通大学
这些学校都是化学专业考研的热门选择，具有很高的学术声誉和教育实力。建议您根据自己的兴趣、研究方向和地理位置等因素，综合考虑这些学校，并查询学校官网或咨询相关教育机构，以获取最准确的信息。