南京理工大学通信与信息系统专业的考研方向包括：
通信理论与技术：
研究通信的基本理论、方法和系统，包括信号传输、信号处理、通信网络等。
随机信号理论与应用：
研究随机信号的数学模型、分析方法及其在通信系统中的应用。
电子系统理论与应用：
研究电子系统的设计、测试和应用，包括电路、微电子、光电子等。
网络安全对抗：
研究网络安全相关的理论、技术和应用，包括网络攻防、信息安全和密码学等。
电路与系统：
研究电路与系统的理论、分析、测试、设计和物理实现，是信息与通信工程和电子科学与技术之间的桥梁。
电子与通信工程：
涉及信息与通信系统和电子科学与技术两个一级学科，包括信息传输、信息交换、信息处理、信号检测、集成电路设计与制造、电子元器件、微波与天线、仪器仪表技术、计算机工程与应用等。
模式识别与智能系统：
研究模式识别与智能系统的理论和技术，包括人工智能、AR虚拟现实技术、信息处理和智能系统构建等。
通信安全：
研究通信系统中的安全问题，包括通信加密、安全协议和网络安全等。
移动通信：
研究移动通信系统的设计、实现和应用，包括3G、4G、5G等。
建议根据个人兴趣和职业规划，选择合适的研究方向。例如，对信号处理和通信网络感兴趣的学生可以选择通信理论与技术和电子与通信工程；对人工智能和模式识别感兴趣的学生可以选择模式识别与智能系统。