南京大学和上海财经大学都是国内顶尖的财经类高校，各有其优势，因此考研难度也各有不同。以下是一些关于两校考研难度的比较：
招生人数
南京大学：2017年考研，南京大学金融专硕和学硕合计拟录取人数为31人。
上海财经大学：2017年考研，上海财经大学金融硕士各个方向加起来拟录取人数超过了150人。
从招生人数来看，上海财经大学的招生规模明显大于南京大学，因此从录取概率的角度来看，上财相对好考一些。
专业实力
南京大学：南京大学是985高校，金融专业实力较强，尤其是金融素养方面的考察较为严格。
上海财经大学：上海财经大学的金融学是国家重点二级学科（培育），在财经金融圈子里的知名度和综合实力都比南京大学强很多。
从专业实力来看，上海财经大学在金融领域的专业优势更为明显。
地理位置
南京大学：位于江苏南京，就业主要集中在上海、江苏等地。
上海财经大学：位于上海，就业全国通吃，尤其是上海，具有明显的地理优势。
如果打算在上海就业，上海财经大学可能更具吸引力。
建议
如果你更看重招生人数和专业实力，且希望在上海就业，上海财经大学可能是更好的选择。
如果你更看重学校的综合排名和影响力，且不特别在意就业地点，南京大学可能更适合你。
最终选择哪所学校，还需结合个人的兴趣、职业规划以及实际情况进行综合考虑。