基础医学考研的院校排名如下：
北京大学
北京大学基础医学学院成立于1918年，历史悠久，研究能力和综合实力国内领先，是培养高水平医学人才的重要基地。
北京协和医学院
北京协和医学院是中国较早设有八年制临床医学专业和护理本科教育的重点医学院校，与中国医学科学院实行院校一体的管理体制，被誉为“中国医学殿堂”。
复旦大学
复旦大学基础医学专业国内领先，秉承“育人、育才、育科”的办学理念，提供全面、高质量的教育和培训，科研系统健全。
中山大学
中山大学是教育部直属高校，国家“985工程”“211工程”重点建设的高水平研究型综合性大学，文理医工农艺学科齐全，综合实力居内地高校前八。
上海交通大学
上海交通大学基础医学专业备受关注，毕业生就业率高、薪资待遇好，设有临床医学硕士专业，培养高端人才。
哈尔滨医科大学
哈尔滨医科大学在基础医学领域有较高声誉，是培养医学人才的重要基地。
南方医科大学
南方医科大学在基础医学领域也有很好的表现，受到考生的青睐。
建议
北京大学和 北京协和医学院在基础医学领域具有极高的声誉和影响力，是考研的理想选择，尤其是对于希望从事高水平科研和临床工作的学生。
复旦大学和 上海交通大学也是不错的选择，它们在基础医学教育和科研方面都有很强的实力。
中山大学作为综合性大学，其基础医学专业与其他学科交叉融合，有利于学生全面发展。
哈尔滨医科大学和 南方医科大学等高校在特定领域有优势，可以根据个人兴趣和职业规划进行选择。
综合考虑学校的教学质量、科研实力、就业前景等因素，建议考生和家长仔细研究各高校的排名和特色，选择最适合自己的考研院校。