软件工程专业的学生在考研时可以选择的专业主要包括：
软件工程
研究用工程化方法构建和维护软件。
涵盖程序设计语言、数据库、软件开发工具、系统平台、标准、设计模式等方面。
计算机科学与技术
涵盖计算机软、硬件系统的设计、开发。
研究计算机在各学科、工程、生活中的应用。
计算机应用技术
培养具有计算机系统与信息处理知识，数据库管理、数据处理能力。
从事信息产业、商务服务业信息采集、处理及分析工作。
计算机技术（专业硕士）：
扩展计算机系统功能，发挥其在各学科、工程、生活中的作用。
包括计算机软、硬件系统的设计、开发及相关应用系统的研究、开发和应用。
以上专业均可以在软件工程考研时作为方向选择。选择哪个专业取决于个人的兴趣、职业规划以及对未来工作的期望。