日语考研确实存在专业限制，这些限制主要涉及以下几个方面：
军事和国防类专业：
这些专业通常要求考生具备较高的英语水平，以满足国家安全、机密以及设备操作等方面的需求。例如，国防科技、军事指挥等专业。
英语专业及外贸相关专业：
这些专业的研究和学习重点集中在英语语言、文学和商务英语沟通方面，对考生的英语水平有较高要求。例如，英语语言文学、商务英语、国际经济与贸易等专业。
传媒、国际关系、外交类专业：
这些专业通常涉及国际交流、文化传播等领域，需要考生具备良好的英语沟通能力。例如，广播电视编导、新闻学（国际新闻方向）、国际关系、外交学等专业。
部分医学、法学专业：
这些专业涉及大量的专业术语和国际交流，通常需要考生具备较高的英语水平。例如，临床医学（涉外方向）、法学（国际法方向）等专业。
语种教学限制：
部分高校虽然开设了日语专业，但在课程设置和教学上可能会有一定的限制，例如要求日语专业的学生必修英语或其他外语课程，以满足学科交叉和国际化教育的需求。
学习资源限制：
由于中国的日语教育市场相对较小，且部分高校对日语专业的投入不足，因此日语专业的学生在学习资源上可能会受到一定的限制，这可能会影响他们的学习效果和未来的发展。
就业前景限制：
虽然日语专业在就业市场上具有一定的优势，但相对于英语专业来说，其就业前景仍然受到一定的限制。
中外合作的专业：
这部分专业由于特殊原因，可能会限制外语情况，考生在报名时需要认真查阅相关的招生简章再选择是否报考该专业。
计算机、软件、翻译、对外经贸等专业：
这些专业可能对日语水平有较高要求，或者需要具备相关的专业背景。
综上所述，日语考研虽然可以跨专业报考，但仍存在一定的专业限制，考生在选择报考专业时需要仔细考虑自身条件和目标专业的要求。建议考生在报考前查阅相关招生简章和专业目录，了解具体的报考要求和限制。