南京大学和南京医科大学都是医学领域的知名高校，各有其独特的优势和特点。选择哪所学校更好， 取决于个人的学习目标和职业规划。以下是它们之间的一些比较：
专业实力
南京医科大学：在医学专业方面，南京医科大学的实力较强，特别是在口腔医学领域，其专业认可度在江苏省内是最高的，并且拥有丰富的教学资源和临床实践机会。
南京大学：南京大学医学院在科研方面实力强劲，拥有丰富的研究资源和优秀的教授团队，注重培养学生的科研能力。
考研难度
南京医科大学：虽然南京医科大学的专业实力强，但考研难度也相对较高，因为学校的招生名额较少，竞争激烈。
南京大学：南京大学作为985高校，考研难度也较高，但相对于南京医科大学，可能稍微容易一些，因为南京大学医学院的招生名额较多。
就业前景
南京医科大学：南京医科大学的毕业生在江苏省内的三甲医院有较高的认可度，就业前景较好。
南京大学：南京大学作为综合性大学，其毕业生在就业市场上具有更广泛的竞争力，不仅限于医学领域。
校园文化和氛围
南京医科大学：学校注重严谨的学术态度和专业的医学教育，校园氛围较为严肃。
南京大学：南京大学医学院注重学生的综合素质培养，有丰富的学生活动和多元化的课程设置，校园氛围较为活跃。
建议
如果你希望从事临床医生工作，并且希望留在江苏省内，南京医科大学可能是更好的选择，因为其在医学教育和临床实践方面的优势更为明显。
如果你希望在医学领域从事科研工作，或者希望进入更广泛的就业领域，南京大学可能更适合你，因为其在科研方面的实力较强，并且作为综合性大学，就业前景更广阔。
最终的选择还应结合你的个人兴趣、学习能力和职业规划来做出。建议你可以先了解两所学校的具体招生情况、教学资源、临床实践机会等方面的信息，再做决定。