南通大学的冷门专业包括 马克思主义理论和 日语专业。
马克思主义理论
根据查询升学网显示，马克思主义是科学的世界观和方法论，是反映客观世界特别是人类社会的本质和规律的科学真理。因此，该专业被认为是冷门的。
日语专业
南通大学日语专业的招生人数相对较少，就业市场上的竞争也较激烈，因此被视为冷门专业。
然而，随着中日关系的不断发展，日语专业的需求也在逐渐增加，未来可能会有更多的就业机会。
建议：
如果你对日语专业感兴趣，尽管目前就业竞争激烈，但随着市场的需求增加，未来可能会有更好的发展前景。
马克思主义理论作为一个科学的世界观和方法论，虽然被认为是冷门，但其学术价值和就业前景仍然值得关注。