音乐指挥专业考研的院校包括：
中央音乐学院
中国音乐学院
天津音乐学院
沈阳音乐学院
上海音乐学院
星海音乐学院
四川音乐学院
武汉音乐学院
浙江音乐学院
哈尔滨音乐学院
此外，以下学校也提供音乐指挥专业的考研机会：
西南民族大学
重庆师范大学
广西师范大学
北京师范大学
华东师范大学
陕西师范大学
湖南师范大学
山东大学
中央民族大学
南京师范大学
延边大学
西藏大学
华南师范大学
西南大学
华中师范大学
中国传媒大学
这些院校在音乐指挥专业方面都有各自的优势和特色，建议考生根据自己的兴趣、专业背景和职业规划，综合考虑各学校的师资力量、教学设施、学术氛围等因素，选择最适合自己的考研院校。