辞职考研时，档案的处理方式通常有以下几种：
档案转至人才交流中心
向当地人才交流中心提交档案托管申请，并支付相应费用。
拿到托管协议后，将其交至原单位人事处，由单位协助将档案转至人才交流中心。
确认档案已安全转移至人才交流中心，大约半个月后去人才市场确认。
档案留在原单位
向原单位申请保留档案，并按照单位要求办理保管手续。
如果原单位同意保留档案，在找到新工作单位后，可以将档案迁至新单位所在地。
档案由学校保管
如果是在校学生辞职考研，可以选择将档案留在学校，待落实工作单位后再将档案迁至工作单位所在地。
档案由个人保管
如果不介意档案暂时无人管理，可以选择将档案由个人保管，直到找到新的工作单位后再进行转移。
档案转移至生源地
将档案转至生源地的人力资源和社会保障局下属人才交流中心，由个人办理托管手续。
档案转移至新单位
如果辞职后马上有新的接收单位，可以将档案、劳动关系、社保和公积金等全部转移到新单位。
请注意，不同单位可能有不同的具体政策和操作流程，建议提前咨询相关单位了解详细情况。另外，辞职后，五险一金（养老保险、医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险和住房公积金）的处理方式也有所不同，可以根据个人情况和未来计划进行选择。