工作期间考研违约金的数额 取决于三方签订的合同中是否有明确的规定。以下是几种可能的情况：
一般情况
如果合同中没有明确规定，那么员工考上研究生一般不需要支付违约金。许多公司会支持员工继续深造，尤其是体制内的员工，如机关事业单位的在编人员，他们通常没有合同约定违约金。
特殊情况
如果合同中有明确的违约金条款，违约金的数额通常最高可达五千元人民币。
违约金的计算方式可能包括培训费除以约定的服务年限，乘以违约年限。
法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十二条，用人单位为劳动者提供专项培训费用并进行专业技术培训的，可以约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。
其他相关条款
《劳动合同法》第二十三条涉及劳动者为用人单位从事保密业务的违约金约定，但这与考研情况不直接相关。
建议
查阅合同：首先，员工应查阅与用人单位签订的劳动合同，了解其中是否有关于违约金的具体条款。
沟通协商：如果合同中有违约金条款，员工应与公司进行沟通，说明情况并尝试协商减免或调整违约金。
法律咨询：如果沟通无果，员工可以咨询专业律师，了解自身权益和可能的法律途径。
最终，是否支付违约金以及支付多少，应以劳动合同中的明确约定为准。