漫画故事专业考研学校主要包括以下几所：
中国美术学院：
作为国内顶尖的美术类院校，中国美术学院的漫画专业全国知名，课程设置涵盖了漫画制作的各个环节，注重创意和实践能力的培养。
中央美术学院：
中央美术学院在美术和设计领域有很高的声誉，其动画专业也备受瞩目。
广州美术学院：
广州美术学院是八大美院之一，在动画和漫画专业方面也有一定的知名度和影响力。
四川美术学院：
四川美术学院同样是八大美院之一，其漫画专业也备受关注。
中国传媒大学：
中国传媒大学在传媒领域享有很高的声誉，其动画与数字艺术学院在动漫教育方面有着不俗的实力。
北京电影学院：
北京电影学院是我国较为著名的媒体类院校之一，其动画专业在国内外都拥有较高的声誉，漫画专业强调学生的创作能力和创新精神。
上海戏剧学院：
上海戏剧学院在动漫专业考研方面也有一定的知名度和影响力。
吉林艺术学院：
虽然吉林艺术学院可能不接收跨专业报考，但其设计学专业和艺术设计专业在漫画方向上有一定的招生名额。
清华大学美术学院：
清华大学美术学院在动画和漫画专业方面也有较高的教学水平和研究实力。
南京艺术学院：
南京艺术学院是国内较早开设动画专业的院校之一，其动画专业在国内外享有较高的声誉。
这些学校在漫画故事专业的考研方面都有各自的优势和特色，建议根据自己的兴趣、专业背景和职业规划，选择合适的院校进行报考。