种子科学与工程专业考研的主要方向包括：
作物遗传育种：
研究作物遗传改良及种子生产的理论、方法与技术的科学。培养目标包括掌握作物学的基础理论和系统的专门知识，拓宽有关作物遗传学、育种学、作物栽培学和耕作学的理论知识和实践技能，能胜任本学科的教学、科研、推广及管理工作。研究方向涵盖作物种质资源创新、作物育种原理与方法、作物杂种优势机理及利用、作物分子育种及细胞工程、作物基因组学等。
作物栽培学与耕作学：
培养能从事作物生产关键技术问题研究、作物学基础研究、农村资源环境综合研究和农业生产系统分析与耕作制度设计的专业人才。要求具备较深的现代植物生理与生物化学知识，对重大作物生产与作物生理生化研究的前沿能融会贯通，具备开展相关实验的设计和操作能力。
作物学：
研究作物生长发育、产量、品质、抗逆性及其与环境条件的关系，为作物生产提供科学依据和技术支持。该专业涉及种子生产、种子量控制、种子利用、种子科学基础知识等方面的内容。
建议
选择专业：根据个人兴趣和研究方向，选择适合自己的专业方向。作物遗传育种和作物栽培学与耕作学是种子科学与工程专业中较为热门和实用的方向。
准备考试：考研初试通常包括思想政治理论、英语、数学（或化学）以及相关专业课。建议提前规划好复习计划，选择合适的复习资料，如徐涛的政治视频课、张剑的阅读黄皮书、肖秀荣的1000题等。
关注招生信息：不同高校在考试科目、参考书目、研究方向等方面可能有所不同，建议关注目标高校的招生简章，了解具体的招生要求和复试科目。
通过以上信息，你可以更好地规划自己的考研方向和准备工作，从而提高考研的成功率。