微生物考研方向包括但不限于以下几个领域：
资源与应用微生物学：
研究微生物资源及其在农业、工业、医学等领域的应用。
病源微生物学：
研究病原微生物及其与宿主的相互作用，以及微生物引起的疾病。
微生物发酵与代谢工程：
研究微生物发酵过程及其代谢产物的利用。
生物防治微生物学：
研究利用微生物进行生物防治的方法和技术。
环境微生物学：
研究微生物在环境中的生理生化过程及其对环境的适应性。
真菌学：
研究真菌的形态、分类、生理、生态、分布、发生、遗传、进化等。
微生物生态：
研究微生物与其环境之间的相互作用及其生态过程。
分子生物学方向：
研究微生物基因的结构、功能及其表达调控。
工业微生物学：
研究微生物在工业生产中的应用，如生产抗生素、酶等。
环境微生物学：
研究微生物在环境中的生理生化过程及其对环境的适应性。
极端环境微生物学：
研究在极端环境下（如高温、低温、高盐等）生存的微生物。
微生物制药：
研究微生物在制药工业中的应用，如生产疫苗、生物药物等。
海洋微生物学：
研究海洋中的微生物及其生态过程。
选择考研方向时，学生可以根据自己的兴趣和职业规划进行选择。同时，不同的学校和研究机构可能会有不同的研究方向和特色。