南京工业大学考研的专业课包括以下几类：
电路理论与应用系列课程；
计算机技术系列课程；
信号与系统；
电磁场理论；
数字系统与逻辑设计；
数字信号处理；
通信原理；
338生物化学；
856基础有机化学；
612微生物学；
812生物化学二；
637有机化学；
802物理化学；
803材料科学基础；
806机械材料力学；
807机械设计；
809工程热力学；
810化工原理；
817信号系统与数字电路；
819电路；
820自动控制原理；
823管理学；
825工程建筑与管理；
828数据结构与操作系统；
833结构力学；
840安全工程学；
842环境微生物学；
843安全学原理与应用；
863材料力学；
865材料物理化学；
31. 868暖通工程热力学；
32. 869水力学；
33. 专业综合笔试（包含专业基础知识、实验技能、实验室安全、专业英语等）。
建议您根据自己的研究方向和兴趣，选择相应的专业进行报考，并详细查阅相关专业的参考书目和考试大纲，以便更好地准备考试。