南京有三本考研的大学包括：
南京大学金陵学院
东南大学成贤学院
南京航空航天大学金城学院
南京理工大学紫金学院
南京师范大学中北学院
南京医科大学康达学院
南京中医药大学翰林学院
南京信息工程大学滨江学院
南京邮电大学通达学院
南京农业大学
南京林业大学南方学院
南京工业大学浦江学院
中国药科大学
南京艺术学院
南京审计学院金审学院
金陵科技学院龙蟠学院
南京工程学院康尼学院
中国传媒大学南广学院
南京理工大学泰州科技学院
南京师范大学泰州学院
建议：
南京大学金陵学院和 东南大学成贤学院是南京地区较为知名的三本考研院校，拥有较好的教学资源和师资力量。
南京航空航天大学金城学院和 南京理工大学紫金学院等学院在理工科领域有较强优势，适合对特定专业有兴趣的学生。
南京医科大学康达学院和 南京中医药大学翰林学院等医学和中医药类专业的学院也备受关注。
根据个人兴趣和职业规划，可以选择合适的学院进行报考。