基因工程考研的科目主要包括以下几类：
公共科目
思想政治理论：所有工学门类考生必考的科目，考察政治理论素养和思想道德水平。
英语：学术型硕士（学硕）一般考察英语（一），专业型硕士（专硕）可能考察英语（二），具体以各院校招生简章为准。
数学：工学门类中对数学要求较高的专业会考察数学（一），内容涵盖高等数学、线性代数、概率论与数理统计等。
专业科目
生物化学与分子生物学：包括核酸生物化学、基因工程、蛋白质结构与功能、基因表达调控、基因工程疫苗、结构生物学、代谢组学、细胞与分子机理等。
细胞生物学：与遗传学和细胞生物学一起考察，涉及细胞的基本结构、功能和遗传关系。
分子生物学：包括基因组的结构与功能、基因的分子结构与功能、基因表达调控、基因工程载体及其构建、植物基因转化受体的建立、根癌农杆菌Ti质粒介导基因转化、发根农杆菌Ri质粒载体基因转化、DNA直接导入基因转化等。
基因工程：主要考察基因工程的基本概念、基本原理、常用技术和方法及其在生物医药领域的应用。
其他科目
大学物理：某些学校可能会考察物理化学等相关科目。
建议考生根据具体报考的学校和专业方向，仔细查阅相关院校的招生简章，了解更详细的考试科目和考试要求。