北京医学考研学校选择时，可以考虑以下因素：
学校声誉和实力
北京协和医学院：被誉为“中国医学殿堂”，是国家世界一流学科建设高校和国家卓越医生教育培养计划项目试点高校，拥有较高的声誉和医学教育水平。
北京大学医学部：作为“985”和“211”工程高校，集教学、科研、医疗为一体，学科覆盖医学门类中的多个学科，以精英教育为本，重视科学研究与临床实践相结合。
复旦大学上海医学院：虽然是“985”和“211”工程高校，但以科研型硕士为主，竞争较为激烈。
专业特点
北京协和医学院：设有八年制临床医学专业和护理本科教育，其临床医学院和研究所实力出众。
北京大学医学部：在医学影像学、基础医学、临床医学等多个领域具有优势，尤其是影像学科在国内处于领先地位。
复旦大学上海医学院：在医学影像学领域有显著优势，适合希望深入科研的学生。
地理位置和实习机会
北京协和医学院和 北京大学医学部均位于北京市，实习机会多在本省或县级医院，且可能跨省实习。
首都医科大学地处北京，地理环境优越，各个附属医院实力强，虽然既不是“211”也不是“985”院校，但学校排名较靠前，每年报考人数众多，录取比例较低。
保研比例和招生政策
“985”和“211”院校的保研比例较高，留给外校学生名额较少，性价比不高。而“双非”院校保研比例不高，对外招收人数多，机会大一些。
个人兴趣和发展方向
选择医学院校时，应结合自己的兴趣和研究方向，以及与医学院的师资力量和科研资源等因素综合考虑。
建议：
如果你希望进入顶级医学院校，且学术基础扎实，目标明确，可以考虑 北京协和医学院或 北京大学医学部。
如果你希望在医学影像学领域深入发展， 北京大学医学部和 复旦大学上海医学院是不错的选择。
如果你希望获得更多实习机会，且愿意考虑非“985”和“211”院校， 首都医科大学是一个值得考虑的选择。
最终选择时，建议综合考虑自己的实际情况和长期规划，做出最适合自己的决定。