民办本科毕业生在就业考研时，可以选择以下专业：
会计学专业
适合考研的学校包括上海财经大学（与上海国家会计学院联合培养）、复旦大学、上海交通大学、上海大学、华东理工大学、同济大学、南京大学、南京财经大学、南京农业大学、江苏大学、河海大学、中国矿业大学、江苏科技大学、南京理工大学、南京航空航天大学、东南大学、苏州大学等。
医学专业
医学专业尤其是临床医学和口腔医学专业报名非常火热，虽然学习难度较大，但未来发展趋势良好，薪资也较高。
电子信息类专业
随着互联网普及，电子信息类专业需求量大，薪资高，是民办院校中的热门选择。
金融专业
金融专业高大上，适用面广，无论是就业还是考研都有很好的前景。
英语专业
英语专业适合英语基础好的学生，尤其是那些高考分数仅够上民办二本的学生，可以通过发挥英语优势逆袭。
市场营销专业
市场营销专业在市场经济时代尤为重要，大学期间可以结识大量人脉，就业前景较好。
法学专业
法学专业毕业生虽然多，但拿到法律职业资格证书的较少。在民办高校，要想在这一行有所发展，需要付出更多努力。
通信工程专业
通信工程专业在互联网时代非常吃香，虽然本科毕业就业不太理想，但考研后含金量高。
临床医学专业
临床医学专业本科毕业后就业不理想，很多学生选择考研以提高学历和竞争力。
数学与应用数学专业
该专业本科毕业后就业难度大，但考研后会有大量就业机会。
经济学专业
经济学专业虽然就业前景好，但竞争激烈，考研可以提高学历和竞争力。
建议学生在选择考研专业时，结合自己的兴趣和职业规划，选择适合自己的专业和学校。同时，提前了解相关专业的就业前景和考研难度，做好充分的准备和规划。