自考本科毕业生在考研时可以选择的院校非常广泛，包括但不限于以下几所：
1. 综合类大学
北京大学
复旦大学
南京大学
2. 工科大学
中南林业科技大学
华南理工大学
山东大学
重庆大学
北京工业大学
河北工业大学
太原理工大学
长安大学
南昌大学
辽宁大学
延边大学
东北林业大学
安徽大学
3. 师范类大学
湖南师范大学
华中师范大学
4. 财经大学
湖南商学院
长沙理工大学
湖南工业大学
5. 艺术院校
中央戏剧学院
北京电影学院
6. 其他高校
南通大学
扬州大学
暨南大学
汕头大学
广东药科大学
广州中医药大学
中山大学
请注意，不同学校和专业对自考生可能有不同的报考条件和限制，建议考生在报考前详细查阅目标院校的招生简章和相关政策。