排名前三的市政工程专业考研学校如下：
清华大学：
作为国内顶尖的学府之一，清华大学在市政工程领域拥有雄厚的师资力量和科研实力，提供优质的教育资源和学术氛围。
同济大学：
同济大学在市政工程领域也具有较高的声誉，学校设立了专业的市政工程研究院，致力于培养高水平的市政工程人才。
华中科技大学：
华中科技大学的市政工程专业也备受认可，学校注重理论与实践相结合，培养学生的综合能力。
此外，以下学校也推荐作为考研市政工程专业的好选择：
重庆大学：
学科门类齐全，涵盖理、工、经、管、法、文、史、哲、医、教育、艺术11个学科门类，市政工程专业备受认可。
西安建筑科技大学：
建筑学、土木工程、工程管理、城乡规划、建筑环境与能源应用工程、给排水科学与工程、环境工程、材料科学与工程、冶金工程、计算机科学与技术、功能材料11个专业相继通过国家专业评估认证。
浙江大学：
在市政工程领域具有较高的声誉，学校设立了专业的市政工程研究院。
东南大学：
在市政工程领域也表现优异，适合考研。
北京工业大学：
市政工程专业备受认可，适合考研。
天津大学：
在市政工程领域有一定的实力，适合考研。
西南交通大学：
在市政工程领域表现不错，适合考研。
这些学校在市政工程领域都有较高的声誉和实力，可以根据个人兴趣、学术目标和地理位置等因素进行选择。建议进一步了解各学校的具体招生政策、研究方向和导师情况，以便做出更明智的决策。