微生物学考研的好大学包括：
北京大学- A+ 学科，微生物学专业在学术界享有极高的声誉。
清华大学- A+ 学科，综合性强，在微生物考研领域同样具有举足轻重的地位。
上海交通大学- A 学科，实力雄厚，是微生物学考研的热门选择。
中国农业大学- A 学科，以生命科学、农学和农业工程为特色，微生物学专业是国家级重点学科。
南京大学- A 学科，微生物学专业研究实力强，学科基础扎实。
中国科学技术大学- A 学科，科研实力突出，微生物学专业同样表现优异。
武汉大学- A 学科，微生物学领域是国家级重点科研单位，拥有高学术声誉的科研团队。
复旦大学- A- 学科，微生物学研究方向多样，包括微生物生理代谢和遗传等。
浙江大学- A- 学科，微生物学专业研究水平高，就业前景广阔。
江南大学- A- 学科，尤其在微生物发酵方向具有显著优势。
以上排名不分先后，每所学校都有其独特的优势和研究方向，建议根据自己的兴趣和目标进行选择。