系统安全考研院校排名如下：
1. 武汉大学
2. 电子科技大学
3. 山东大学
4. 上海交通大学
5. 杭州电子科技大学
6. 中国刑事警察学院
7. 南京邮电大学
8. 北京邮电大学
9. 北京航空航天大学
10. 哈尔滨工业大学
11. 四川大学
12. 华中科技大学
13. 西安电子科技大学
14. 中国科学技术大学
15. 东北大学
建议在选择考研院校时，除了参考排名情况，还需要结合自己的实际情况和兴趣，仔细了解各个学校的学科特点、师资力量、研究方向和就业前景等因素，以便做出最适合自己的选择。