船长在考研时，可以考虑以下专业：
船舶与海洋工程
专业介绍：这个专业主要研究船舶的设计、建造和维护，以及海洋工程结构的设计、施工和维护。考研方向包括船舶与海洋工程结构、船舶设备、海洋工程、水下技术等。
土木工程
专业介绍：土木工程专业涉及建筑、桥梁、道路、隧道等基础设施的设计、建设和维护。考研方向包括结构工程、岩土工程、交通工程、水利工程等。
机械工程
专业介绍：机械工程专业关注机械设备的设计、制造、控制和维护。考研方向包括机械设计、机械制造、机械电子工程、机电一体化等。
电气工程
专业介绍：电气工程专业涉及电力系统的设计、开发和维护，以及电气设备和控制系统的设计和应用。
海洋科学与技术
专业介绍：这个专业研究海洋的自然现象、物理特性、生物资源以及海洋资源的开发利用。考研方向包括物理海洋学、海洋化学、海洋生物学、海洋地质学等。
根据以上信息，如果船长希望在船舶与海洋工程领域深造，那么船舶与海洋工程、船舶与海洋结构物设计制造、流体力学等专业都是不错的选择。此外，土木工程、机械工程和电气工程也适合对基础设施、机械和电力系统感兴趣的专业人士。海洋科学与技术则适合希望深入研究海洋资源开发利用的船长。
建议船长根据个人的兴趣和职业规划，选择最合适的专业进行考研。