辞职考研时，基金的处理方式如下：
养老保险
可以选择停止交费，形成缴费年限中断，但个人账户积累停止。
也可以选择个人全额缴纳，即不中断缴费，将过去连同企业缴纳的部分一并自己缴纳。
如果到外地谋职，可以办理保险转移手续，到新的就业地区。
找到新的工作单位后，可以按原账号继续缴费，不用补交，但不能退。
医疗保险
处理方法基本同养老保险，个人账户里的钱可以在当地继续使用。
工伤保险、失业保险、生育保险
这三种保险辞职后自动解除。
失业保险只要缴费满一年，且非个人原因造成的失业，就可以领取。
住房公积金
有个人账户，辞职后只是停止了存钱，但账户的钱还是你的。
符合公积金提取规定，可以随时提取，以后也可以续交，永远不会作废。
个人参保办理转移的条件
转往单位就业涉及重复缴费的个体参保人员已被单位录用并到劳动部门办理录用备案手续。
转往单位就业不涉及重复缴费个体参保人员已被单位录用并签订劳动合同，单位自个人缴费截止时间后续缴社会保险。
转往三县及外地个体参保人员在外地参保，需要把保险转移至外地。
法律依据
《中华人民共和国社会保险法》规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。
失业人员应当持本单位为其出具的终止或者解除劳动关系的证明，及时到指定的公共就业服务机构办理失业登记。
其他注意事项
辞职考研后，当事人可以自行购买社保，由社保代缴机构代缴，也可以在参加工作之后补缴。
养老保险缴费年限是累计计算的，中间允许有空档，可补可不补。
住房公积金可以取出来，本人到所在的住房公积金管理处问他们现在如果提取住房公积金需要那些手续，但前提是本人的住房公积金得交够1年以上。
请根据您的具体情况选择合适的处理方式，并咨询当地社保局或公积金管理中心获取更详细的指导和帮助