如果在考研过程中遭到恶意举报，可以采取以下措施进行处理：
保持冷静并与相关部门配合
被举报的考生应保持冷静，积极与相关部门沟通，并提供证据进行申辩，以维护自己的合法权益和名誉。
向报考院校申诉
考研拟录取公示期被恶意举报后，考生可以向报考院校提出申诉。教育部规定，招生单位的研究生招生管理部门必须统一公示拟录取名单，且公示时间不得少于10个工作日，期间名单不得修改。
保护自己的合法权益
考生应积极收集证据，证明自己的清白，避免因恶意举报而受到不公正的处理。同时，也可以寻求法律援助，了解自己的法律权益。
了解相关法律法规
考生应了解考研相关的法律法规，如《国家教育考试违规处理办法》等，以便在必要时维护自己的权益。
避免违规行为
考生应严格遵守考试纪律，避免任何形式的违规行为，以免给自己带来不必要的麻烦。一旦被发现违规行为，可能会面临严重的后果，包括取消考试成绩、取消招生资格，甚至开除学籍。
通过以上措施，考生可以更好地应对恶意举报的情况，维护自己的合法权益和名誉。同时，也应加强法制观念，远离考试作弊行为。