卫生专项限制考研的原因可能包括以下几点：
需求矛盾：
卫生专项计划旨在培养和输送全科型人才，以满足基层医疗卫生服务的需求。而考研通常是为了提升学历和专业技能，这两者的需求可能存在矛盾。
服务期要求：
免费医学生或定向医学生有服务期的要求，违反这些要求可能会涉及违约，并需要支付违约金。例如，定向医学生可能需要毕业后在乡镇卫生院服务一定年限，而考研可能需要支付违约金，金额可能在10-15万不等。
培养目标：
国家医疗卫生系统可能更倾向于使用全科型人才来服务基层，以提升基层医疗服务的质量。
政策导向：
政府可能希望通过限制考研来确保医学生能够满足基层医疗服务的需求，而不是追求更高层次的教育。
以上解释基于提供的信息，实际情况可能因具体政策、地区差异和个体情况而有所不同。