制药工程考研专业课主要包括以下几个方面：
政治：
所有考研学生必考的一门科目，主要考察政治理论知识和时事政治。
英语：
一般要求英语一或英语二，主要考察英语阅读、写作、翻译等能力。
数学：
通常为数学二，考察高等数学、线性代数、概率论与数理统计等。
药学基础综合一或药学基础综合二：
不同院校有不同的考试科目，一般包括生物化学、有机化学、物理化学、微生物学、药物化学、药剂学、药理学等科目的综合考试。
专业课一和专业课二：
有些院校会根据研究方向的不同设置不同的专业课，这些科目通常包括专业基础课和专业实务课，部分院校会采用教育部统考试题。
具体到某些院校的考试科目，例如：
北京理工大学制药工程专硕考研科目包括：思想政治理论、英语二、数学二、化工原理。
山西大学制药工程专硕考研科目包括：思想政治理论、英语二、数学二、物理化学（不含结构化学）。
东北农业大学制药工程专硕考研科目包括：思想政治理论、英语二、生物化学、生物技术概论。
建议学生在准备考研时，查阅目标院校的招生简章，确认具体的考试科目，以便更有针对性地进行复习。