土木工程在职考研主要通过以下两种方式进行：
同等学力申硕
入学申请：向土木工程学位授予单位提交同等学力在职课程班入学申请，并通过资格审核。
课程学习：通过研究生课程进修班学习、全日制在校硕士研究生培养方案规定的学位课程学习或自学。
申硕考试：通过国家组织的同等学力人员申请硕士学位外国语水平和学科综合水平全国统一考试。
论文答辩：提交硕士学位论文并通过学位授予单位组织的答辩。
获得学位：经国务院学位委员会批准，授予同等学力人员硕士、博士学位。
专业硕士
报名确认：考生需要按统一的时间和程序报名，包括网上报名和现场确认两阶段，报名入口为研招网。
全国联考：由教育部统一组织，主要考政治、英语二、数学二和专业课，全部科目均为笔试。
院校复试：由各招生单位自行组织，考核内容一般有专业基础知识、个人综合能力、外语口语与听力测试等。
录取学习：复试结束后，各招生单位会择优录取排名靠前的考生。学员入学后需在学制内修完课程学分，通过院校考核。
答辩获证：论文开题报告通过后，学员在规定时间完成学位论文，通过答辩，可获得院校颁发的研究生毕业证书和硕士学位证书。
建议
同等学力申硕适合工作年限较长、希望获得硕士学位证书的人员，考试相对容易，但需要完成课程学习和论文答辩。
专业硕士适合希望获得双证（学历和学位）的人员，需要参加全国统一考试和院校复试，竞争较为激烈。
根据个人情况和职业发展需求，可以选择最适合自己的报考方式。