考研选择日语作为外语的劣势主要包括：
调剂限制
有些学校在复试调剂时可能只接受英语考生，日语考生可能会面临调剂困难。
学习资源有限
日语教材和辅导资料相对较少，获取学习资源的途径有限。
学习压力大
日语对于许多考生来说是新的语言，需要从零开始学习，可能会带来较大的学习压力。
就业前景
英语在科研、高校和企业中的使用更广泛，日语人才可能在就业市场上遇到一定限制。
学术研究限制
学术界的重要研究成果多以英文发表，掌握英语能力对学术研究至关重要。
学校选择范围小
多数学校倾向于要求英语作为外语，限制了选择日语作为外语的院校范围。
听力、阅读和写作要求高
日语考试对这三项技能的要求较高，需要考生具备较强的语言综合运用能力。
以上劣势需要在选择考研外语时予以充分考虑。