考研微生物的专业主要包括以下几种：
资源与应用微生物学：
研究微生物资源的开发和应用，包括微生物在农业、工业、医学等领域的应用。
病源微生物学：
研究病原微生物的生物学特性、致病机制和防治方法。
微生物发酵与代谢工程：
研究微生物发酵过程及其代谢产物的生产和应用。
生物防治微生物学：
研究利用微生物进行生物防治的方法和技术。
环境微生物学：
研究微生物与环境之间的相互作用及其在环境保护中的应用。
真菌学：
研究真菌的生物学特性、分类、生态和代谢等。
微生物学：
研究微生物的基本生物学特性、分类、生理、代谢、遗传变异和进化等。
分子生物学：
研究生物大分子如蛋白质、核酸的结构、功能和相互作用关系。
生物化学：
研究生物体内化学过程和物质。
生物技术：
利用生物系统、活体或其部分进行生产、加工和处理的技术。
建议在选择考研微生物专业时，结合自己的兴趣和职业规划，详细了解各个专业的具体研究方向、培养目标和考试科目，以便选择最适合自己的方向。