生物工程考研后的研究方向主要有以下几个：
生物制药：
研究利用生物技术生产药物的方法，包括药物研发、生产和评价。
生物医学工程：
研究应用生物技术和工程技术解决医学问题的方法，包括医学影像、生物传感器、生物材料等。
生物信息学：
研究生物大数据的收集、存储、处理、分析和应用的方法，包括基因组学、蛋白质组学等。
生物制造：
研究利用生物技术生产各种物质的方法，包括生物能源、生物基材料等。
生物化学与分子生物学：
从微观即分子的角度研究生物现象，探讨生命的本质，研究生物体的分子结构与功能、遗传信息的传递等。
微生物学：
研究微生物及其生命活动的基本规律和应用的科学，涉及细菌、病毒等微生物的研究。
细胞生物学：
研究细胞的结构、功能、生命周期及其在生物体中的作用和相互作用。
建议选择与个人兴趣和职业规划最为匹配的专业方向，以便更好地发挥个人优势和深入研究。例如，对药物研发感兴趣的学生可以选择生物制药方向，对医学影像和生物传感器感兴趣的学生可以选择生物医学工程方向。