公司发现员工考研报名 不应该影响就业。以下是具体的分析和建议：
系统封闭性
考研报名的网站在网报期间是封闭的，系统开放时段外不能查看、修改和报名。这意味着在报名期间，员工提交的信息是隐蔽的，用人单位很难发现员工参与了考研报名。
诚信问题
虽然有些应届生会选择瞒着用人单位考研，但这种行为并不被鼓励，因为它涉及到诚信问题。如果被发现，可能会对员工的职业生涯产生负面影响。
补充协议
很多单位可以签订补充协议，规定如果员工考上了研究生，之前的协议自动作废或需要支付一定的违约金。这样可以减少因员工考研而带来的潜在纠纷。
信息查询难度
考研报名信息属于个人隐私，企业通常没有权限去查询这些信息。即使员工考上了研究生，单位一般也只会查看学生个人信息系统中的更新，而不会去核实之前的报名情况。
信息安全保护
个人的身份信息已经通过多种手段得到了保护，包括人脸识别、手机验证码识别等。因此，即使考研报名信息被泄露，也不会对员工的个人安全造成太大威胁。
建议
诚信为本：员工应该诚信地对待自己的职业选择，如果决定考研，最好提前告知用人单位，并尽量通过补充协议等方式减少潜在的风险。
提前沟通：如果员工担心考研会影响现有工作，可以提前与用人单位沟通，说明自己的职业规划，并了解单位的政策和态度。
保护隐私：在报名考研时，员工应注意保护个人隐私，避免信息泄露给无关人员。
综上所述，公司发现员工考研报名不应该影响就业，但员工应诚信行事，并提前与用人单位沟通以减少潜在风险。