东京大学毕业后考研有以下几种方式：
国内申请日本研究生（过渡修士）
适合国内出身名校、平均分高、不换专业、英文日语好的学生。
可以直接选定大学和教授，通过发邮件与研究计划书获得教授内诺。
申请时间建议至少提前一年开始。
优点是学费较便宜，申请难度相对较小。
缺点是国内出身校不好、平均分不高的学生拿到教授内诺的几率小；研究生不是正式修士，身份较尴尬。
申请日本语言学校——申请在日研究生或考修士
适合日语零基础的学生，可以在语言学校快速提升日语水平。
语言学校提供大学院升学辅导，但大部分还需另出钱报名私塾。
学生可以在语言学校期间备考修士，通过考试后入学。
优点是学习环境较好，有更多接触教授的机会。
缺点是过渡时间长，费用较多。
利用雅思或托福成绩申请英文授课修士
适合英文较好的学生，可以直接申请英文授课的修士项目。
申请流程包括准备语言成绩、研究计划书，然后直接联系目标大学的教授。
优点是节省时间，直接进入大学院学习。
缺点是可以申请的学校和专业范围受限，且对英语要求较高。
国内日语满足N2以上水平，直接申请日本大学研究生
学生需要联系目标大学的教授，表达读研究生并考修士的意愿。
教授同意后，准备材料进行“出愿”。
优点是节省时间，直接进入大学院学习。
缺点是申请过程较为复杂，需要较强的自我驱动能力。
建议
提前规划：建议至少提前一年开始准备，包括语言学习和研究计划的撰写。
提升语言能力：日语必须达到N1水平，英语建议托福或托业成绩达到要求。
选择合适的方式：根据自身情况选择最适合自己的方式，如语言学校过渡、直接申请研究生或英文授课项目。
充分利用资源：在日本学习期间，多参加教授的讲座和说明会，了解研究方向，利用好学校提供的资源。
保持积极态度：考研过程可能会遇到挑战，保持积极态度，坚持努力，最终会取得理想的结果。