南开大学考研的冷门专业包括：
哲学、历史学、宗教等文科类专业：
这些专业实践性不强，就业岗位有限，主要集中在科研所、学校、出版社等，且需求人数不多，因此报考人数较少。
地质、矿业等理工类专业：
这些专业通常需要在野外工作，条件较为艰苦，也是考研的冷门选择。
生物科学专业：
生物科学专业通常被认为是“生化环材”四大天坑专业之首，需要长时间的学习和研究，例如直博可能需要读八年，因此也是许多考生考虑的冷门选项。
化学专业：
虽然化学专业在某些人看来可能较为冷门，但仍有学生基于兴趣和选择权选择该专业。
选择考研专业时，除了考虑专业的冷热程度，还应结合个人兴趣、职业规划以及未来的发展方向来做出决策。如果你对某个专业有浓厚的兴趣，并且认为它符合你的职业目标，那么即使它是冷门专业，也可能是一个值得考虑的选择。