员工在处理考研问题时，可以从以下几个方面进行考虑：
法律层面
根据《劳动合同法》，单位一般不能因为员工在职考研而开除员工，除非员工严重违反用人单位的规章制度或严重失职给单位造成重大损害。
如果员工因考研严重影响工作，单位可能有权依据相关规定解除劳动合同，但需提前告知并支付相应的经济补偿。
单位政策
有些单位可能会支持员工在职考研，甚至提供一定的帮助，如灵活的工作时间或学习时间。
提前与单位沟通，说明考研的目的和计划，争取单位的理解和支持，有助于减少潜在的冲突。
时间管理
制定合理的学习计划，充分利用业余时间进行学习，避免影响工作。
合理安排工作和学习时间，确保两者之间取得平衡。
档案处理
确保档案材料完整和准确，包括个人基本信息、学业成绩、推荐信、证书和奖励等。
对于国企员工，可能需要向公司人力资源部门申请临时档案，并在考研成功后将档案提交给新单位。
档案处理方式可能因单位而异，包括档案转移、保留或不予处理，建议提前咨询并了解相关政策。
合同条款
检查劳动合同中是否有关于离职考研的相关条款，如有，需考虑违约金等问题。
如果没有相关条款，员工可以自由辞职并准备考研，但建议提前与单位沟通，避免不必要的纠纷。
通过以上几个方面的考虑和准备，员工可以更好地处理在职考研的问题，确保既能够实现自己的学术目标，又能保持工作的稳定性。